Taustajärjestelmäintegraatioiden merkitys korostuu erityisesti laajan valikoiman verkkokaupoissa, joissa tarvitaan usein integraatioiden tukea niin tuotetietojen kuin kassajärjestelmä- ja varastosaldojen ylläpitoon. Useisiin ViidakkoStore-alustalle tehtyihin verkkokauppoihin on toteutettu esimerkiksi ERP-järjestelmän ja verkkokaupan tai kassajärjestelmän ja verkkokaupan välinen integraatio. Yleensä integraatiot toteutetaan kaksisuuntaisina, jolloin tieto siirtyy molempiin suuntiin järjestelmien välillä. Näin voidaan helpottaa esimerkiksi kivijalkamyymäläverkoston ja verkkokaupan yhtäaikaista ylläpitoa sekä tietojen päivittymistä reaaliajassa.